Las memorias flash por definición están orientadas a la lectura y no a la escritura, tienen una cantidad de escrituras limitada...
http://es.wikipedia.org/wiki/Memoria_flash Cita: todos los tipos de memoria flash sólo permiten un número limitado de escrituras y borrados, generalmente entre 10.000 y un millón, dependiendo de la celda, de la precisión del proceso de fabricación y del voltaje necesario para su borrado.
Saludos
PD: Sería de lujo tener mi computadora en el pen drive y que funcione de forma permamente como el hard disk...