Es complicado con lo que tienes :\
Por qué no usas file() como te han dicho, y podrás saltar a la siguiente linea simplemente con continue;
Código PHP:
$f = file("tu_archivo");
foreach($f as $linea) {
// en $linea tienes toda una linea completa
// continue; aqui saltará a la próxima linea
}
Exitos ^^