Bueno, lo de nevigation, solo es cosa de cambiarle esta imagen:
http://www.icamilo.com/templates/wr_...athway_tag.gif
Lo del orden de los contenidos lo haces en el menu superior de la administración:
Menu -->
mainmenu -->
Inicio -->
Editar
Y ahi le puedes decir si lo quieres de 2 columnas, o de una sola o como quieras hacerlo ;)
Si lo quieres todo hacia abajo, pues solo dejalo con el parametro asi:
Columns: 1
O simplemente empieza a jugar con esos parametros hasta que te guste como queda ;)