Un archivo html que incluye frames dentro de si puede ser confuso cuando lo despliegas en dreamweaver, sobretodo si le quitas los bordes a los frames. Pero bueno, creo que eso ya lo comprobaste
Te recomiendo que habras tu archivo (desde el panel lateral ó el Menú-Abrir) y si que selecciones nada (Si estas en vista Diseño) cambies a la vísta código. Desde ahí podras configurar tus frames o lo que necesites.