Hola, hay diversos tipos de malwares, entre ellos se encuentran los Spywares y los Virus. Para prevenir y eliminar virus están los antivirus y para los spywares están los Antispywares.
Superantispyware es un antispyware por lo que no hay problema si tienes los 2 como residentes.
"Normalmente" los antivirus no reconocen o no deberían reconocer los spywares debido a que no contienen código malicioso, pero las tecnologías aplicadas actualmente como la heurística, hacen que puedan detectarlos y eliminarlos.
Saludos
