Saludos astut.
Para usar variables de php en una funcion js podrias llevar la variable en el value de un campo input
Cita: <TD><input readonly name=\"valor\" id=\"valor\" VALUE='$valor' type=\"text\" size=\"10\" maxlength=\"10\" onBlur=\"nombre(this,document.getElementById('valo r'))\" ></td>
Y para tu segunda pregunta no puedes ejecutar consultas sql en js ya uqe js funciona al lado del cliente y php al lado del servidor
Hasta Pronto!!