Lo primero que yo te recomendaría, es sin dudas, aprender a usar Linux bajo CentOS en este caso.
Aqui encontrarás un buen manual para comenzar a usar la consola, está en español y va desde cero.
CentOS es un clon de RedHat Enterprise, por lo que creo que no te vendrá mal leer
estos manuales también, son más específicos para la administración.
Ten en cuenta, que administrar un servidor Linux remotamente, no es trabajo sencillo, todo lo contrario, requerirá mucho esfuerzo y estudio. Por eso primero, te acosejo que lo pruebes localmente en tu PC, aprendas a estudiar sus servicios, configuraciones, soluciones a problemas, etc.
Saludos,