Hola:
Cuando abras esos popups debes usar variables para poder tener la referencia:
var popups = [false, false, false, false, false];
// para cada pestaña puedes usar un ítem del array.
popups[0] = window.open(...);
Luego, cada popup que se cierre poner el índice asociado a false, y por último al cerrar sesión hacer un bucle...
for (var i = 0, total = popups.length; i < total; i ++)
if (popups[i]) popups[i].close();
Espero que te sirva.
Saludos
