Pero vamos a ver... si sabeis programar aplicaciones para PC tampoco tendreis problema con las PDA's. El único inconveniente es que la versión Framework para las PDA's es reducida (Compact Framework).
No existe manuales para estudiar sino para consultar cualquier duda concreta.
Normalmente trabajo en estas cositas y suelo consultar en:
http://foro.todopocketpc.com http://www.pocketpcdn.com/forum http://forum.xda-developers.com http://www.modaco.com/forums.html
Y muchos más...
Saludiños