Cita:
Iniciado por Shiryu_Libra 
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lo que hiciera fuera esto, al ir seleccionando los checkbox, en el evento onclick, voy agregando a un campo hidden los values de estos, y cuando hagas el evento unload, de esa ventana, pasas tus IDS, al campo que requieres
De acuero con que es con JavaScript, pero no sería mejor en lugar de tener que controlar si esta seleccionado o no para agregar/quitar esos valores del hidden, solamente en el último proceso, iterar todos los objetos de la forma y si es un checkbox y está seleccionado, agregar su valor a una variable para pasarla a la forma padre? podría ser un poco menos complejo...
aunque seguramente si este tema es trasladado al foro de JavaScript, saldrán con una mejor solución, cuestión de esperar.
Salud