¿Cómo que no te funciona? ¿Qué error te da? He probado el código en FF2 y en IE6.
Código PHP:
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<html>
<head>
<title></title>
<meta name="Author" content="derkeNuke">
</head>
<body>
<input type="checkbox" name="Cat_0" />
<input type="checkbox" name="Cat_1" />
<input type="checkbox" name="Cat_2" />
<input type="checkbox" name="Cat_3" />
<input type="checkbox" name="Cat_4" />
<script>
setTimeout( function() {
for(var i=0; i<=4; i++) {
var elCheck = document.getElementsByName("Cat_"+i);
elCheck[0].checked = "checked";
}
}, 1000);
</script>
</body>
</html>
Prueba con este ejemplo concreto con retardo de un segundo para estar más seguros... no puede ser.