Sobre la instalación de programas, leed el manual de Ociomax acerca de
Instalación de programas en GNU/Linux.
Cita:
Iniciado por El_Pantera 
Mi duda es ¿cómo saber qué programas tengo instalados?
Empieza por decirnos qué distro usas. Si usas una distro basada en Debian (Ubuntu, Knoppix, la propia Debian...), puedes ver todos los programas instalados mediante Synaptic (por ejemplo).
Cita: ¿es posible ver diferenciar los programas que se instalaron al instalar el SO de los que uno como usuario instala?... que a veces uno instala por instalar y ya no sabe qué es de qué...
Creo que no es posible. Pero esperemos a ver qué cuentan los demás usuarios del foro, quizás sepan algo que yo no sé.