mira con java script puedes hacer algo parecido a el explorador de windows hay muchos scripts como ese que buscas por que no te das una vuelta por dinamicdrive (algo asi) y buscas uno
y en lo que respecta a mostrar el contenido de los directorios supongo te refieres a los que tienes en tu server eso yo lo haria con PHP por que con java script no se puede claro adaptando el scrips de java script metiendo le los datos de las carpetas con los resultados que te de PHP
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