¿Con qué navegador trabajas? ¿Es esa ventana justo un popup creado por tu código javascript?
Si es en FF por lo menos no puedes cerrar si no es una ventana creada por javascript, se ve claramente el error:
Cita:
Iniciado por FF2.0.0.4 Los scripts no pueden cerrar ventanas que no hayan sido abiertas por un script.
En IE ya no sé como funciona, me desvinculé de él. La versión 6 creo que te permitía cerrar lo que quisieras.
Un saludo.