Bueno, je je je, no debes usar las tijeras que aparecen en grande en medio, con que selecciones el espacio que quieres dejar con eso basta, el programa toma únicamente lo que seleccionaste, si usas las tijeras estas haciendo una selección inversa, estas quitando lo que no quieres en el video y dejas lo demás...
La verdad esta más simple en alterior TMPGEnc, mi versión 2.52 esta totalmente clara, este es un lío de ntrada, entendamos que, la interface dejó de ser "intuitiva"