si como incluyo mi archivo externo, te refieres a generar un js y de ahi integrarlo a tu html o php o sea cual fuese el lenguaje de desarrollo el Tag para hacerlo es:
Código HTML:
<script type="text/javascript" src="mijs.js"></script>
y asi, tendras un archivo js, que podras utilizar mas de 1 vez en varios sitios y sin tener que volver a escribir todo el codigo... salu2