en linux hay un camado llamado du, muestra el tamaño de un directorio y de todos su directorios dentre de este.
tambiem lo puedes complementar con asi: du -hcs y te mostrara el tamaño del directorio.
ahora en php
Código PHP:
$tamano = `du -hcs` ;
echo $tamano;
OJO `du -hcs` son acentos al reves