Hola walvaRo,
Esta llamada lo que hace es justamente llamar MC's externos (tambien jpg, gif, y en la verson 8 png!) y cargarlo en el MC desde donde fue llamado, como si fuera parte del mismo (en el caso de loadMovie()). Con loadMovieNum("url", nivel); cargas un swf (jpg, gif, png) externo en el nivel que le indiques. lo que dices de MC's vacios se hace con createEmptyMovieClip("nombreInstancia", nivel); que te crea un MC vacio para usarlo en lo que quieras, cargar MC's externos o de la libreria, imagenes, etc.
Como recurso basico FIEL y completo en referencias de Action Script te recomiendo la ayuda de flash (F1), es el mejor manual para entender el script, y luego la web esta llena de tutoriales. Tambien te recomiendo la pagina de Bandit.