Hola Docker.
En el código de tu web sale los estilos css de cada capa como #Layer1, #Layer2, etc...
Supongo que lo has diseñado con dreamweaver y el te ha puesto la posición con pixels. Si no quieres complicarte mucho la vida, tendrias que sustituir las medidas por porcentaje. Teniendo en cuenta que lo has diseñado para 1280*1024, tiene que coger la referencia total del ancho, y, por ejemplo en la capa 1, que tienes un atributo left de 242, deberias cambiarlo por el porcentaje que represente esto sobre el total del ancho de la web (1280)
Asi sucesivamente con los atributos de posicion de todas las capas.
Aún asi no se si te quedara perfecto, pero creo que si te funcionara. Ya nos diras algo