Hasta donde se, hay modulos de apache para eso.
por ejemplo este :
http://download.tangent.org/mod_layout-3.4.tar.gz
el mod_layout, te permite poner un header y footer en las paginas.
tendrás que probarlo a ver si te sirve para lo que lo quieres usar, sino buscar modulos similares, creo que debe de haber otros que hagan lo mismo o algo similar.
Saludos.