Hola josecmorales, acá ferny explica cómo hacerlo paso a paso (a mi me sirvió bastante

)
http://www.mundodivx.com/subtitulos/avi.php
Solo que el VirtualDubMod acepta subtítulos ssa, Yo me bajé un programita gratuito llamado srt2ssa y me pasa los subs sin problema al formato ssa (en lo personal le hago un ajuste de 25 px más arriba los subs, ya que veas el programita lo veras)