Hola:
Los métodos open tienen un segundo parámetro que es la ventana donde se abrirá el enlace... cuando se debe abrir en la página activa (la que tiene el enlace) puedes usar "_self"... aunque si vas a usar un enlace, puedes usar el propio enlace para una de las páginas y el evento click para enlazar en el otro marco:
<a href="http://www.forosdelweb" target="frame1" onclick="window.open('http://www.google.com', 'frame2')">abre 2 paginas</a>
Si alguno de los enlaces es hacia "_self" creo que es mejor usar el href del tag a...
Saludos
