Hola:
A simple vista no pones bien las comillas... antes del punto de concatenación debes tener una cadena encerrada entre comillas iguales (tu empiezas con dobles y sigues con sencillas...)
<a href="modificar_producto.php?linea=$i&cant=".$_GET['cantidad$i']" onClick="Modificar('$i')">update</a>
No sé si he enacadenado bien...
Saludos
