Hola again
Bueno, en cuanto a lo de las medidas del pop up a mi me abre bien en iexplorer y en firefox con las medidas correctas, esta asi
<a href="#" onClick="javascript
:window.open(
'imprimirDOC.php?cod=<?php echo $reg['ID_CS'];?>','','width=430','height=260');">IMPRIMIR</a>
entonces no se cual sera el problema que tengas, sin embargo prueba quitando las comillas sencillas de $reg['ID_CS'], quedandote $reg[ID_CS] a ver si de pronto esta poniendo problema por eso, saludos