Mostrar/Ocultar capas sin dejar el espacio que ocupan

[Asyolath]

Una de dos:

O le das posición absoluta a las capas...
...o en la función de ocultar capas redimensionas las capas a 0px por 0px y en la función de mostrar capas la vuelves a redimensionar a su tamaño por defecto.

Si posteas tu script quizás pueda ayudarte mejor

Edit: O haces lo que dice JavierB :D