Hola:
Tienes que descargarlas y ponlas en algún directorio, el que tú quieras. Te pongo los enlaces, aunque no te puedo asegurar que sean esas
http://portals.apache.org/pluto/ http://jakarta.apache.org/commons/fileupload/ http://www.pdfbox.org/
Una vez que las tengas, saca con el botón derecho del ratón las propiedades de tu proyecto eclipse y busca "build-path", "libraries", "add external jar" y los vas añadiendo a tu proyecto.
Se buena.