Yo he hecho esto y me ha funcionado:
Código PHP:
<select name="nombre" multiple>
<?php
$arr_nombres=explode(",",$_GET['id']);
$result = mysql_query("SELECT * FROM tabla") or die (mysql_error());
while ($rows0 = mysql_fetch_array($result))
{
extract ($rows0);
?>
<option value="<?php echo $nombre;?>" <?php if(in_array($nombre,$arr_nombres)) echo "selected";?>><?php echo $nombre; ?></option>
<?php
}
?>
</select>