Limitar el uso de CPU a MySQL

[chancha]

Esta pregunta la hice en otro foro (en el de MySQL) pero nadie me respondió. Entonces la hice aquí, pero me la borraron supongo por estar repetido. Ahora, si nadie me la respondió en el otro, que tiene de malo venir a consultarlo en un foro de administradores de servidores?. No estoy repitiendo la misma consulta en cualquier ámbito, sino en aquellos acorde a los tipos de usuarios que los visitan, y que no necesariamente son los mismos en ambos foros. Además, tampoco es que la repito por que se me canta las ganas, sino por que en el primer foro que decidí consultarlo, nadie me pudo ayudar. Es por eso que ahora la hago en otro foro, donde los usuarios no son los mismos que en el primero.
Me parece correcto no permitir consultas repetidas, pero creo que se debería analizar con cierto razocionio cada caso. Agradezco mantener este post y no borrarlo.

Ahora si, yendo al grano...

En mi PC local (windows xp) tengo instalado un MySQL 4.1.x, en el cual corro generalmente una aplicación que hace consultas que demoran cerca de una hora, y mantienen el consumo del CPU al 100% lo cual implica no poder usar la PC para casi nada por que se vuelve muy lenta y se traba todo. Obviamente, cuando termina la consulta, la performance de la PC vuelve a la normalidad.

Existe, dentro de la configuración del MySQL, alguna forma de limitarle la cantidad de CPU que consume o el nivel de prioridad de uso del PCU?.

La idea es poder correr estas consultas y poder seguir usando la PC.