A mi me sucede lo mismo pero no he cambiado la carpeta de descargas, me pasa de apagar la máquina a prenderla
Lo soluciono desinstalando el programa y limpiando el registro y volviendo a instalar (por supuesto perdiendo las descargas en curso

).
Funciona un tiempo y me vuelve a pasar lo mismo, las descargas se congelan y no puedo ni cancelarlas ni nada y las nuevas que agrego nunca comienzan.
También pasé todos los anti virus y anty spyware pero nada algunos troyanos que se eliminan pero el problema no se soluciona.