Hola yoyes:
Si que se puede (Mickel, lo acabo de probar), la forma de referenciarlo supongo que es algo más complicado.
Yo recuerdo haber usado document.getElementById("El_Iframe").src para cargarlo, supongo que en vez de "src" tendrás que usar los atributos del documento, por ejemplo:
document.getElementById("El_Iframe").doc ument.getElementById("El_Tag_del_Iframe" )...
Saludos