Hola:
Ahora entiendo, pero no creo que lo puedas hacer... tal vez puedas superponer la capa al iframe, pero desde la página contenedora, pero sería difícil de programar, y si se trata de dominios distintos, supongo que será imposible...
Haré una pruebas, pero tal vez sea mejor que en el iframe, reacomodes las capas.
Saludos