Hola, ante todo decirte que FDISK /MBR solo funciona en Windows 9x y ME, si tienes uno de esos sistemas operativos puedes haber hecho un buen paso reparando el MBR, aunque cuando una infección afecta al MBR también es conveniente recuperar el sector de arranque con un
sys c:, este comando debe ser ingresado en modo DOS iniciado desde un disco de arranque.
Por el contrario si tuvieses Windows XP debes entrar a la consola de recuperación desde el CD de instalación de Windows XP, digitar el comando
FIXMBR para reparar el MBR y luego el comando
FIXBOOT para recuperar el sector de arranque.
Como recomendación, si deseas realizar formateos a bajo nivel no debe utilizarse programas distintos a los provistos por la empresa que fabrica los discos duros, entra a la página del fabricante de tu disco duro que ahí debe haber herramientas diseñadas especialmente para tu disco, con otras herramientas cabe la posibilidad que dañes tu disco.
Saludos