Bueno ya pude arreglarlo con la ayuda de DeeR lo que faltaba era sólo sumarle 1 a la variable $i y quedo de esta manera
Código PHP:
<td><?php echo $i; ?></td>
Para quien le pueda servir, lo que hace el script es generar una gráfica de barras usando la librería
graphpico extrayendo valores desde mysql, ahora ya funciona bien, gracias por su ayuda, dejo el script para quien le pueda ser útil.
Saludos