Código PHP:
<?php
function callback($arch){
return filemtime($arch);
}
$vec2=glob('*');
$vec1=array_map('callback',$vec2);
$vec=array_combine($vec2,$vec1);
asort($vec);
$vec=array_keys($vec);
echo '<pre>';
print_r($vec);
echo '</pre>';
?>
Esto te entregaría una matriz con los archivos ordenados en función a la última modificación.