Hola, la infección debes eliminarla en
Modo Seguro y activando la opción
Ver Archivos Ocultos. Así podrás ver y eliminar el archivo infectado manualmente y sin problemas:
C:\WINDOWS\Downloaded Program Files\
explorer.exe
Si el archivo no se dejara eliminar puedes utilizar el programa
FileASSASIN
Tras estos pasos elimina los temporales y cookies desde las opciones de tu navegador o automáticamente con el programa
Disk Cleaner
Saludos