Aquí tienes las funciones de directorio:
http://es2.php.net/manual/es/ref.dir.php
y las funciones del sistena de archivos
http://es2.php.net/manual/es/ref.filesystem.php
Pero ten en cuenta un detalle, si tienes contratado un hosting, ponte en contacto con él para que te informen si el servidor web soporta esta característica, ya que habitualmente suele estar desabilitado por motivos de seguridad.