Podrias (particularizado para windows):
1:crear una carpeta temporal :
bot.exec("cmd.exe /C /MIN md c:\dirtemp");
2:descomprimir el ejecutable en la carpeta temporal
bot.exec("cmd.exe /C /MIN jar -x C:\camino1\camino2\fichero.jar c:\dirtemp\fichero.exe");
3:ejecutarlo
bot.exec("c:\dirtemp\fichero.exe");
4:borrado
bot.exec("cmd.exe /C /MIN del c:\dirtemp\*.* /y");
bot.exec("cmd.exe /C /MIN deltree c:\dirtemp");
Chuidiang tiene una wiki y habla de los jar:
http://www.chuidiang.com/chuwiki/ind...e=Ficheros_jar
salu2