Prueba esto:
<script language="javascript">
function borrar(archivo) {
seguro = confirm('¿Está seguro de querer borrar '+archivo+'?');
if(seguro) {
window.location.replace('nuevoLugar.php?borrar='ar chivo);
// o, con prototype.js, por ejemplo:
new Ajax.Request('paginadeborrado.php?filename='+archi vo, {onSuccess: function(t) {alert('Archivo borrado satisfactoriamente')}, onFailure: function(t) {alert('Error al borrar el archivo, puede que se haya borrado igualmente o haya un error de programación o de comunicación. Inténtelo de nuevo');}});
}
}
</script>
<a href="javascript
:borrar('asdf.ghj')">Borrar asdf.ghj</a>
Espero no haberte liado con tantos {} y (), xDD
Para hacer lo de new Ajax.request...... debes de usar prototype o hacerte tu propio sistema para comunicación por AJAX.