A niveles técnicos seria una respuesta larga y pesada de leer, a niveles mas "de andar por casa" el tema es el tipo de señal, con el VGA tienes conexión analogica, con la DVI es digital, lo cual mejora aquello que ves en la pantalla, tu gpu no va a ser mejor por tener una conexión u otra, eso si, es preferible DVI por ser digital.
Adjunto un
enlace con mas información.
Un saludo.