Que tal omegafunky.
Yo hice una pruba para pasar datos de SQL server a mySQL y la herramienta mySQl Migration Toolkit , que viene en mysql-gui-tools-5.0, me funciono bien, aunque mi base de datos sólo tenia tipo de datos simples, es decir, varchar, int, datetime y char. No hubo problemas, incluso me paso los constraints de llave foraneas.
El único problema que tuve fue con los campos que tenian un valor por defaull.
Espero te sirva ese programa.
Lo puedes descargar de
http://dev.mysql.com/downloads/gui-tools/5.0.html.
Saludos y suerte!