bueno, para ser sinceros es un tema un poco amplio el que se esta tocando, pero va tener también mucho que ver el $$$ que tengan en la empresa, la capacitacion los tipos de SO que tienen etc, para poder montar una arquitectura óptima para lo que estas buscando.
Si estas basandote en CORBA estás hablando más de un modelo de arquitectura empresarial más que física de comunicacion y/o sincronización que es en tu caso.
Ahora que si piensas en web services son más orientados (como su nombre lo dice) a servicios que también en este caso estás hablando de ficheros a través de un medio de comunicación que a mi forma de ver no le veo sentido utilizar un web servie para usarlo como transportador, lo vería más como un caller que un sender.
Cita: y dado que necesito independencia de lenguaje y de sistema operativo
entonces no podría entrar COM+
Ahora si nos enfocamos a tecnologías microsoft una alternativa muy buena podría ser en dejarle el trabajo a los ETL´s de SQL SERVER 2005 mediante los integration services para permitir el envío de ficheros, comunicacion, etc, y mezclado con windows services para la automatización podría ser una alternativa, ahora que si tienes el suficiente $$$ ya podemos hablar de BizTalk para usarlos como medio de orquestación para el manejo, monitorio, etc de todos tus procesos.
Como te comentaba, sería bueno saber si tienes ciertas restricciones tanto de SO como de software, para también buscar otras alternativas, recuerda que tiene mucho que ver la necesidad, usabilidad, clientes, etc.
Aclaro que ésta es mi opinión general, y todo puede variar conformo a lo que te menciono arriba.
Salu2