Aparte tienes que siempre mantener bien aseado el cpu... el polvo puede traerte problemas. Ten en cuenta que posiblemente por utilizacion de nuevo software derrepente se esta "sobrecargando" tu RAM o tu video... y justamenet si parpadea se podria decir que "piensa"... Otra razon seria conflicto de drivers o dispositivos...derrepente podrias comprarte una memoria de 256 para crear el balance de 1024, y aumentarle capacidad a tu cpu.
Otra razon no sabria la verdad