Bueno pues asunto arreglado asi que me respondo yo mismo, al final he conseguido deshacerme del mensajito de marras, tan fácil como seguir estos pasos:
-Ir a Internet Explorer (¿todos los problemas vienen del mismo sitio? Que conste que navego con el zorrito

)
-Ir al menú Herramientas -> Opciones de internet -> Opciones avanzadas -> En la sección 'examinar' de la lista hay que marcar las opciones 'Deshabilitar la depuracion de secuencia de comandos', tanto la de internet explorer
como la de otros.
Al parecer IE está en todos los jaleos, menos mal que a veces es tan fácil como recurrir a él para encontrar el problema
Un saludo, espero que le sirva a alguien si llega a tener el mismo problema.