Hola:
Si están en un arreglo, puedes "aplanarlo" con join() para convertirlo en una cadena...
document.forms.elForm.elHidden.value = elArreglo.join(",");
El método join de los arreglos, los convierte en una cadena, separando los ítems por la cadena (o carácter) que se le pasa como parámetro.
Saludos
