Hola HMSJUAN.
Normalmente, en estos casos de facturación deberás crear una DB, que tu maestro sea el encabezado de la factura y tu detalle otra tabla que arrastre los conceptos a pagar.
Eso es un buen comienzo:
1. Tabla maestro "fctra"
2. Su tabla detalle "dtlle_fctra"
3. Table de los conceptos a pagar "cncptos".
Esto en cuanto a la DB de "prueba" no?. En cuanto a Php, tendrás muchas cosas por definir, muchas restricciones y mucho, pero mucho ciudado en su manejo, por que estas jugando con la info monetaria de la empresa. Ten en cuenta que una factura se vence y por lo tanto, para el próximo mes deberás arrastrar su valor.
Saludos y espero te sirva!!!