Sólo me voy a referir a la página de inicio:
1- El tamaño del archivo logo.gif los haz tocado tanto en el tag IMG como mediante javascript. Al redimencionar las imágenes de esa manera siempre perdés calidad.
2- El archivo
sin redimencionar ya está pixelado. Me parece que, si no disponés de los originales, lo vas a tener que redibujar para solucionar ese pixelado.