Recuerdo que en los FAQ de JavaScript se discutía de mejor manera para abrir la ventana nueva. Luego pongo el link al FAQ, pero de ahí uso el código:
Cita: <a href="Hola.html" target="popup"
onClick="window.open ('', 'popup', 'left=50, top=50, width=320, height=240, resizable=no, scrollbars=auto, menubar=no, toolbar=no, location=no, statusbar=no, copyhistory=no');">
Ventana con todas las opciones</a>
Modifica las propiedades que desees cambiando a yes.
Lo que no estoy seguro es la propiedad auto. También tengo la duda de en que casos se pone 0 en vez de no y 1 en vez de yes, por ejemplo en la propiedad fullscreen.
Editado
Voy a preguntar mis dudas de este script en el foro JavaScript. :)