Holas,
Hay varias aplicaciones en modo visual, por ejemplo del mismo MySQL, es el mysqlquery, tambien el mysql browser, yo te recomiendo el SQLYog, es el mas rapido que encontre.
Asi podras administrar mas rapido tu base de datos. Tambien en la misma pagina de MySQL (
www.mysql.org) puedes encontrar varios GUI para manejar tu BD.
Saludos
Gildus