Al hablar de capacidada te refieres a espacio en disco o a la cantidad de registros que almacena como maximo una tabla?. Las tablas de tipo MyIsam o InnoDB tienen una capacidad maxima de 64 TB como dice CBBzun, pero se encuentran limitados por el sistema de archivos que estes usando (FAT, FAT32, NTFS, EXT2, EXT3, HFS) ya que cada uno tiene un limite maximo del tamaño de archivo, si quieres ver mas a detalle cuanto es esta capacidad puedes revisar la documentacion de mysql, aqui te dejo un enlace a una tabla sobre capacidad segun el sistema de archivos:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/es/table-size.html
Sobre la cantidad de registros que puede almacenar, aqui te dejo un parte del manual que habla sobre limites y escalabilidad de MySql:
Cita: Escalabilidad y límites
*Soporte a grandes bases de datos. Usamos MySQL Server con bases de datos que contienen 50 millones de registros. También conocemos usuarios que usan MySQL Server con 60.000 tablas y acerca de 5.000.000 de registros.
*Se permiten hasta 64 índices por tabla (32 antes de MySQL 4.1.2). Cada índice puede consistir desde 1 hasta 16 columnas o partes de columnas. El máximo ancho de límite son 1000 bytes (500 antes de MySQL 4.1.2).Un índice puede usar prefijos de una columna para los tipos de columna CHAR, VARCHAR, BLOB, o TEXT.
Espero te sirva, saludos, cya