A ver... Para modificar y actualizar las Bases de datos, no es necesario tener que descargarselas, para eso pueden utilizar phpmyadmin que es un admin para mysql y de ahí pueden insertar nuevos datos, o armar un pequeño panel de control para manejarlas desde la, eso no es dificil de realizar, cualquier cosa yo los puedo ayudar con Asp, por otro lado si querés descargarte si o si la Bd mySql y editarla en la Pc, hay un programa que es muy util y se llama Mysql-front.
Saludos!